Nukleinsäure-Extraktionssystem

Die Biobank der Medizinische Fakultät benötigt ein Gerät, das automatisiert Nukleinsäuren (DNA, RNA) aus verschiedenen Ausgangsmaterialien mit Hilfe von bead-basierten Methoden (Kits unterschiedlicher Her-steller, z. B. Macherey-Nagel, Zymo) extrahieren kann. Als Ausgangsmaterialien kommen v.a. Buffy Coats und Vollblut menschlichen oder tierischen Ursprungs in Frage, in einem Lauf sollen mindestens 96 Aus-gangsproben bearbeitet werden können. Es soll auch möglich sein, mikrobiologische/virologische DNA und/oder RNA aus unterschiedlich vorbehandelten Proben zu extrahieren, z.B. aus Abstrichproben, Boden-proben oder anderen Umweltproben (außerhalb des zu beschaffenden Geräts vorbehandelt). Die Proben werden entweder in Platten mit 2D-barcodierten Tubes in einem Volumen von 0,1-2 ml auf das System ge-bracht oder in größeren Probengefäßen, z.B. Blutentnahmeröhrchen mit Volumen zwischen 2 und 5 ml. Die verwendeten magnetischen Beads müssen mit Hilfe magnetischer Stäbe, die in die Probe eintauchen, zu-rückgehalten werden können (z.B. King Fisher System oder vergleichbar), eine magnetische Platte soll ebenfalls für eine Verfeinerung der Protokolle auf dem Gerät verfügbar sein. Alle weiteren Funktionen, die zur Umsetzung der üblichen Protokolle zur Nukleinsäure Extraktion benötigt werden, sollen ebenfalls im Gerät integriert sein, z.B. Heiz/Kühl- und Schüttelfunktionen. Die extrahierten Nukleinsäuren sollen in Mikrotiterplatten oder ebenfalls Platten mit 2D-barcodierten Tubes ausgegeben werden. Weiterhin muss das System die Möglichkeit bieten, in einem Workflow die Nukleinsäuren zu extrahieren, die Konzentration der extrahierten Nukleinsäuren mittels Fluoreszenz-Messung zu bestimmen und dann eine Normalisierung eines Teils der extrahierten Proben auf einen festgelegten Konzentrationswert vorzu-nehmen.